Opati:
1358 – 1363 – Antonin
okolo roku 1377 – Jan I.
1376 – 1407 – Prokop
1409 – 1431 – Matěj
1457 – asi 1472 – Jan II.
za krále Vladislava II., okolo roku 1518 – Matouš
okolo r. 1522 – Kašpar
†1538 – Jan III.
po něm opat z kláštera Třeboňského
okolo roku 1539 – Melichar Šumperský
okolo roku 1540 – správce, kanovník u sv. Víta
†1544 – Prokop II.
ještě roku 1559 – Mikuláš I.
okolo roku 1563 – Mikuláš II.
okolo roku 1575 – Mikuláš III., šlechtic z Vencu, rodem z Dolního Ingelheimu
Ondřej, dříve převor kanonie
1576 – 1578 – Jindřich, převor z Dolního Ingelheimu
1578 – †1604 – Jan IV. Mír
1605 – †1609 – Michal Vinkler
1610 – 1611 – Kašpar Čepl (15. února roku 1611 zavražděn při zničení kláštera)
po zničení kláštera – dočasný správce – zderazský probošt Řehoř Link
1613 – 1614 – Augustin Albert Müller
1614 – 1627 – Řehoř Link
1627 – 1637 – Vavřinec Ezechiel Virčkovský z Palmberku, kanovník Augustinián z Olomouce
1637 – 1640 – Vácslav Augustin Hibel
1640 – 1651 – Jan Chrisostom Šrepl ze Šreplsberku, administrátor
1651 – 1681 – Isidor de Croce
1681 – 1684 – Jiří Ignác Jurečko
1684 – 1712 – Jan Vácslav Luňák
1712 – 1724 – Řehoř Samuel Otčenášek
1724 – 1729 – Aleš Josef Bartoloměj Hamák
1729 – 1744 – Tomáš Jan Brinke
1744 – 1751 – Tomáš Josef Girt
1751 – 1760 – Josef Vácslav Poklop
1760 – 1770 – Karel Christoslav Procházka
1770 – 1785 – Augustin Jan Nepomuk Paukrt
________________________________________________
Duchovní správci:
1789 – 1809 – kněží Kapucíni
1809 – 1855 – světští kněží, tzv. exposité
— kolem roku 1822 – P. Tomáš Viták
— kolem roku 1830 – P. František Royt
— kolem roku 1836 – P. Matěj Albert Masný
— kolem roku 1847 – P. Norbert Vambera
1856 – 1869 – Redemptoristé, jejich rektorem byl Antonín Maštalíř
1869 – 1879 – P. Karel Navrátil
1880 – 1884 – P. František Čermák
1884 – 1890 – P. František Jirák
1890 – 1892 – P. František Xaver Ekert
1892 – 1898 – P. Jan Zlat. Kačer
1898 – 1901 – P. Václav Kocián
po roce 1901 – P. Antonín Postřihač
kolem roku 1903 – P. Alois Strnad
———————
1947 – 1958 – P. Antonín Metoděj PETRÁK.
1958 – 1971 – P. Ludvík FELLER.
1971 – 1974 – P. ThDr. Josef PAŠEK, kanovník, administrátor excurrendo, farář u sv. Apolináře.
1974 – 1990 – P. Jan MÁRA O.Cr., kanovník a emeritní probošt vyšehradské kapituly, arciděkan u sv. Ludmily, administrátor excurrendo.
1990 – 1995 – Mons. doc. ThDr. Jiří SKOBLÍK, emeritní kanovník metropolitní kapituly u sv. Víta v Praze, rektor kostela.
1995 – 30. 06. 2016 – M. ThDr. Jiří SVOBODA, JC.D., kanovník metropolitní kapituly u sv. Víta v Praze, zástupce soudního vikáře Metropolitního církevního soudu Arcidiecéze pražské, rektor kostela.
01. 07. 2016 – dosud – P. doc. JUDr. Stanislav PŘIBYL, Ph.D., Th.D., JC.D., rektor kostela.
